El helipuerto que está previsto construir en Formentera para el aterrizaje del helicóptero que efectúa las evacuaciones de accidentados y enfermos entre Formentera y Eivissa podría afectar a la población de aves que habitan de forma temporal o permanente en s'Estany Pudent. Ello se debe a que la construcción de dicha pista de aterrizaje está prevista en la finca de sa Senieta, entre el Centro de Salud y el propio Estany Pudent, cerca de las instalaciones de la depuradora. Por este motivo, el helicóptero debería sobrevolar en sus despegues y aterrizajes un área de gran valor ecológico, como es la comprendida dentro de la Reserva Natural de ses Salines.
El director de la Reserva Natural, Luís Berbiela, mostró en su reciente visita a Formentera cierta preocupación por el tema, toda vez que s'Estany Pudent es utilizado por diversas especies de aves, bien en periodo de migraciones o de forma permanente. En este sentido, el concejal de Medio Ambiente, Xumeu Marí, confesó que se ha preguntado «si el emplazamiento del helipuerto no será negativo para la evifauna». «No obstante -añadió- es una tema que no hemos llevado con el actual equipo de gobierno de la COP, ya que la compra de terrenos por parte del Ayuntamiento se efectuó durante el gobierno del PP y el GIF».